Au fonds primitif constitué par les cartonnages de momies ramenés par P. Jouguet de ses fouilles au sud du Fayoum (Egypte) au début du siècle alors qu'il enseignait à l'Université de Lille, se sont ajoutés divers achats et, par dons et legs, diverses collections : Weill, Bouriant, Théodore Reinach.

L'Institut de Papyrologie conserve également en dépôt une collection qui appartient à la IVe Section de l'Ecole Pratique des Hautes Etudes : les papyrus Graux.

Il s'agit, pour l'ensemble de ces collections, de papyrus (très secondairement de tessons) datés du IIIe siècle av. J.-C. au VIIIe siècle ap. J.-C., grecs pour l'essentiel, mais aussi latins, démotiques, coptes et arabes.

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